посчитал усн за 9 мес . Сумма 12500
Формировал уведомления об исчисленных суммах на налог . ру. Перечислил сумму на ЕНС.

А ща вижу надо 300 руб больше

Можно как то поменять формирование уведомление отправленое ?

ИЛИ надо новое сделать на полную сумму 12800
Или надо новое уведомление на 300 руб

как поступить ?

Не можно, а нужно. 12800

А вот уведомления по НДФЛ и СВ лучше вообще не корректировать. Сейчас вступили в силу изменения в НК РФ и по этому налогу/взносу идёт якорь автозачёта, который потом залипает в их программе и хрен потом поднимешь обратно на тульский кошелёк ЕНС.