В накладной несколько одинаковых позиций разными строками. А сч/ф эти позиции сворачиваются.
Можно ли стандартного этого избежать. Или есть форма сч/ф поправленная

(0) можно.
Наверняка есть готовые формы, да и самому сделать не сложно.

(1) вернее можно, но не стандартно.

(0) А зачем, если не секрет? Счет-фактура это налоговый документ, не предназначенный для приемки/отгрузки товара.
Если позиции одинаковые - наименование, цена, ставка НДС, в чем смысл их в счф по отдельности показывать?
В накладной понятно - могут с разных складов грузиться или в разной таре или еще какая-то специфика, а зачем в счф непонятно...

(3)Заказчику надо. Он сч/ф наши тоже показывает заказчику - а тому надо

Самому сделать СФ как надо, тем более на БП 2.0 это быстро. А вот стандартное поведение системы - таки свернуть.

(4)Из-за одного дебила страдают все