MS SQL 2008 R2:

Делаю следующее:
Begin Transaction

Select TOP 100 [uniqueTradeId], [instrumentId], [MarketTradeTime]
From Transactions with (UPDLock, READPAST)
WHERE [TradeDate] is Null
Order by [MarketTradeTime]

далее в цикле для каждой записи:

update Transactions
SeT [TradeDate] = ?
Where [uniqueTradeId] = ?

Commit Transaction

Индексы:
[uniqueTradeId]  уникальный кластерный
[TradeDate], [MarketTradeTime]  - обычный


При первом же update - выдает превышено время ожидания запроса. Даже в одном потоке. Что не так,
Без - with (UPDLock, READPAST)  работает нормально.

индекс на таблице есть?

посмотри в профайлере что блокируется?
возможно вся таблица

(1) Индексы написал какие есть.
(2) А что транзакция может заблокировать саму себя?

саму себя конечно не может