В Тонком клиенте, есть 2 отчета, практически одинаковых. В процедуре ПриКомпоновкеРезультата  в одном останавливается, а в другом нет, и точка останова становится серой. Что это может быть?

Похоже что нужны телепаты

Серая точка останова означает что она не активна, система не будет останавливатся на такой точке. Сделать не активной её можно нажав специальную кнопку на панели “Отключить точку останова” (shift+ctrl+F9):

не я не нажимал такого, она становится серой после запуска отчета

может быть эта строка отсутствует в исполняемой обработке?

серверная отладка подключена?

да вроде все есть, начал перетаскивать все в другой отчет

(6) по серверным процедурам функциям ходит?