Признак учета (например Валютный) у всех субконто счета стоит, а у самого счета снят. Ведется ли в этом случае валютный учет и надо ли при формировании проводок заполнять валюту ?

попробуй и отпишись по результату.

Насколько я помню, в признаке учета по субконто важно именно его отсутствие, следовательно раз по счету признак снят - то точно не будет учитываться .

нет у счета - нет везде, правильно